อาคารโรงเรียนมหิดลวิทยานุสรณ์มีความปลอดภัย ใช้งานได้ตามปกติ โดยโรงเรียนได้รับความอนุเคราะห์จากสำนักงานโยธาธิการและผังเมืองจังหวัดนครปฐม ลงพื้นที่ตรวจสอบอาคารต่าง ๆ ภายในโรงเรียน หลังเกิดเหตุแผ่นดินไหว เมื่อวันที่ 1 เมษายน พ.ศ. 2568
ดร.พรมงคล จิ้มลิ้ม ผู้ช่วยผู้อำนวยการโรงเรียน พร้อมด้วย นางสาวจิรนันท์ เกรียงธีรศักดิ์ หัวหน้าฝ่ายบริหารทรัพยากรและความปลอดภัย และบุคลากรงานอาคารสถานที่และยานพาหนะ ให้การต้อนรับนายชลิต ไหวไว โยธาธิการและผังเมืองจังหวัดนครปฐม นายภาคภูมิ หงส์อุเทน วิศวกรโยธาชำนาญการ และนายธนิวัฒน์ พุ่มพวง นายช่างโยธาปฏิบัติงาน ร่วมด้วย นายอิทธิพงศ์ จักษ์ตรีมงคล นายอำเภอพุทธมณฑล และคณะ ในการเข้าสำรวจและตรวจสอบความมั่นคง แข็งแรง ของอาคารต่าง ๆ ภายในโรงเรียน ประกอบด้วย อาคารหอพักชาย (อาคาร 9) อาคารหอพักหญิง (อาคาร 7 และ 8) อาคารรับรอง (อาคาร 14) อาคารสำนักงานหอพักและห้องพยาบาล (อาคาร 10) อาคารเรียน (อาคาร 1-3) ห้องฉายภาพยนตร์สามมิติ (อาคาร 16) อาคารหอประชุมพระอุบาลีคุณูปมาจารย์ (อาคาร 5) และสระว่ายน้ำบริเวณศูนย์กีฬา
หลังจากตรวจสอบเรียบร้อยแล้ว ผลปรากฏว่า อาคารดังกล่าวในข้างต้นเป็นพื้นที่สีเขียว เหตุแผ่นดินไหวไม่มีผลกระทบต่อโครงสร้างหลัก มีความปลอดภัย สามารถใช้งานอาคารได้ตามปกติ